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Software zur DNA Analyse gesucht
Software zur DNA Analyse gesucht
Gaspode
07.01.08
09:54
Gibt es für OS X Software zur DNA Analyse ähnlich Origin oder QtiPlot?
Wer hat Erfahrung gesammelt und kann ggf. Hinweise geben oder eine Website mit Infos nennen?
Software darf gerne auch nur mit X11 laufen. Kostenlos natürlich bevorzugt.
Bis jetzt bin ich auf Kaleidagraph (http://www.synergy.com/sysreq.htm) gestossen.
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Kommentare
oefinger
07.01.08
20:02
DNA-Analyse ist ein sehr weitgefasster Begriff. Worum soll es denn gehen?
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oefinger
07.01.08
20:04
Apple meint dazu:
http://www.apple.com/science/software/lifescience.html
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oefinger
07.01.08
20:16
schon mal nen Blick auf R geworfen?
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Gaspode
07.01.08
21:36
Cool, der Apple Link ist ja mehr als ein guter Einstieg (wenn auch wohl seit einer Weile nicht mehr gepflegt). Vielen Dank!!
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oefinger
07.01.08
22:09
QtiPlot ist doch GPL Software
Also "einfach" selbst kompilieren und fertig
Was genau willst du denn analysieren? Geht es nur um ein bisschen Abzählstatistik und hübsche Bildchen oder etwas komplexeres?
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Gaspode
08.01.08
10:26
Das mit QtiPlot hab ich nach dem Posten dann auch gesehen (hallo Edit-Funktion?
)
Also Abzählen und bunte Grafiken müssen auch sein. Aber es geht auch um Analyse und Klonen (Clone Manager und pDraw laufen lt. Herstellerinfos scheinbar auch in VMware etc. ganz gut, die Frage ist ob das performant ist, da fehlt die Erfahrung. Und nativ wäre natprlich immer besser.)
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Arachnid
08.01.08
10:34
guck dir mal geneious an:
.
Oder stöber mal bei MacUpdate:
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Luki
08.01.08
10:36
Hallo Gaspode,
wir benutzen Module vom DNAstar Paket....leider sehr teuer. Für einfache Dinge kann ich noch EnzymeX empfehlen (Shareware oder Freeware). Ist ähnlich im Funtionsumfang wie DNA Strider
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Luki
08.01.08
10:38
Mit Freeware für Plasmid Maps etc. siehts leider schlecht aus. Für den akademischen Bereich ist VectorNTI (via Invitrogene) frei erhältlich...müllt aber das System ziemlich voll.
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Gaspode
08.01.08
11:04
Oh danke, danke. Das ist ja jetzt jede Menge. Das müssen wir uns jetzt erst mal anschauen.
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