Gleich nach der Installation von OS X 10.10 werden vom Festplattendienstprogramm schon folgende 4 Rechte beanstandet:

Zugriffsrechte für „Mac mini Server 2011“ überprüfen

Abweichende Zugriffsrechte für „Library/Java“, Soll-Wert: drwxr-xr-x , Ist-Wert: drwxrwxr-x .
Gruppe von „Library/Preferences/com.apple.alf.plist“ ist 0, korrekt wäre 80.
Der Benutzer von „private/var/db/displaypolicyd“ ist 244, korrekt wäre 0.
Gruppe von „private/var/db/displaypolicyd“ ist 244, korrekt wäre 0.

Überprüfung der Zugriffsrechte abgeschlossen

Solltet Ihr sie auch feststellen, so ist das also kein spezielles Problem Eurer Installation, sondern serienmäßig.